Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Rpusd4Q9CWX4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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