Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Malsu1Q9CWV0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms