Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tdrd12Q9CWU0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Tdrd12Q9CWU0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tdrd12Q9CWU0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Tdrd12Q9CWU0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Tdrd12Q9CWU0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Tdrd12Q9CWU0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tdrd12Q9CWU0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Tdrd12Q9CWU0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms