Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
NubplQ9CWD8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms