Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms