Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ifitm3Q9CQW9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms