Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smim8Q9CQQ0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms