Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkp2Q9CQ73 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms