Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl17Q9CPR4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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