Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms