Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pbx4Q99NE9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pbx4Q99NE9 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pbx4Q99NE9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pbx4Q99NE9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pbx4Q99NE9 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pbx4Q99NE9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbx4Q99NE9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbx4Q99NE9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbx4Q99NE9 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pbx4Q99NE9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms