Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramel1Q99MW3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramel1Q99MW3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramel1Q99MW3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramel1Q99MW3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramel1Q99MW3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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