Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp1b4Q99ME6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp1b4Q99ME6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp1b4Q99ME6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp1b4Q99ME6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp1b4Q99ME6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp1b4Q99ME6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Atp1b4Q99ME6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp1b4Q99ME6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp1b4Q99ME6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp1b4Q99ME6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp1b4Q99ME6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Atp1b4Q99ME6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp1b4Q99ME6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms