Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RtcbQ99LF4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms