Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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