Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms