Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Cldn16Q925N4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Cldn16Q925N4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Cldn16Q925N4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn16Q925N4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn16Q925N4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn16Q925N4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn16Q925N4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn16Q925N4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn16Q925N4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms