Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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