Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms