Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms