Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf6Q91YR7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms