Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pcdhb12Q91Y07 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms