Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klc3Q91W40 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klc3Q91W40 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms