Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg8Q8VE18 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Smg8Q8VE18 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smg8Q8VE18 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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