Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Top1mtQ8R4U6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Top1mtQ8R4U6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Top1mtQ8R4U6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Top1mtQ8R4U6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Top1mtQ8R4U6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Top1mtQ8R4U6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Top1mtQ8R4U6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Top1mtQ8R4U6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Top1mtQ8R4U6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Top1mtQ8R4U6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Top1mtQ8R4U6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1mtQ8R4U6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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