Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim29Q8R2Q0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim29Q8R2Q0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms