Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lin28aQ8K3Y3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lin28aQ8K3Y3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lin28aQ8K3Y3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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