Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OptnQ8K3K8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OptnQ8K3K8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms