Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Ssh3Q8K330 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ssh3Q8K330 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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