Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf39Q8K2Z2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms