Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stn1Q8K2X3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms