Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Mtmr3Q8K296 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtmr3Q8K296 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtmr3Q8K296 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtmr3Q8K296 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtmr3Q8K296 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtmr3Q8K296 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtmr3Q8K296 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Mtmr3Q8K296 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtmr3Q8K296 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtmr3Q8K296 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtmr3Q8K296 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Mtmr3Q8K296 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Mtmr3Q8K296 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Mtmr3Q8K296 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtmr3Q8K296 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtmr3Q8K296 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Mtmr3Q8K296 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtmr3Q8K296 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Mtmr3Q8K296 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Mtmr3Q8K296 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtmr3Q8K296 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Mtmr3Q8K296 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Mtmr3Q8K296 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mtmr3Q8K296 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms