Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Polr1eQ8K202 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Polr1eQ8K202 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms