Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms