Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cldn34c1Q8K193 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn34c1Q8K193 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms