Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc4a8Q8JZR6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms