Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LgsnQ8CIX8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LgsnQ8CIX8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms