Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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SbsnQ8CIT9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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SbsnQ8CIT9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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SbsnQ8CIT9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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SbsnQ8CIT9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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SbsnQ8CIT9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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SbsnQ8CIT9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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SbsnQ8CIT9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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SbsnQ8CIT9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SbsnQ8CIT9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SbsnQ8CIT9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SbsnQ8CIT9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms