Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Card11Q8CIS0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Card11Q8CIS0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Card11Q8CIS0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Card11Q8CIS0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Card11Q8CIS0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Card11Q8CIS0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Card11Q8CIS0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Card11Q8CIS0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Card11Q8CIS0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Card11Q8CIS0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Card11Q8CIS0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Card11Q8CIS0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Card11Q8CIS0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Card11Q8CIS0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Card11Q8CIS0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Card11Q8CIS0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Card11Q8CIS0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms