Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Mterf1aQ8CHZ9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms