Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnka2ipQ8CH19 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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