Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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