Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Pramef8Q8CE24 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Pramef8Q8CE24 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Pramef8Q8CE24 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pramef8Q8CE24 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms