Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam228aQ8CDW1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fam228aQ8CDW1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam228aQ8CDW1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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