Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc38Q8CDN8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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