Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc73Q8CDM4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc73Q8CDM4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms