Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg4aQ8C9S8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Atg4aQ8C9S8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Atg4aQ8C9S8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atg4aQ8C9S8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms