Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933409G03RikQ8C5U0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms