Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc113Q8C5T8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Ccdc113Q8C5T8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Ccdc113Q8C5T8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Ccdc113Q8C5T8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc113Q8C5T8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ccdc113Q8C5T8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ccdc113Q8C5T8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Ccdc113Q8C5T8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ccdc113Q8C5T8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ccdc113Q8C5T8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc113Q8C5T8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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