Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccser1Q8C0C4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccser1Q8C0C4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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